- PNA探针类型
无标记的PNA
-N端的游离胺
– N端的乙酰化作用
带标记的PNA
-N端和C端标记
-双标记
修饰PNA
氨基酸修饰其他适当的官能团修饰
Alpha 或Gamma PNA
-多标记的PNA骨架
-PNA骨架的附加功能
- 设计指南
1. PNA有很好的亲和力一般只需13~18个碱基即可。
2. 富含丰富的嘌呤碱基的序列有聚集现象且溶解度降低。
-嘌呤碱基含量限于80%（建议不要超过60%）
-嘌呤碱基伸展最好不要超过5个
3. 为增加溶解度可以在碱基序列中增加O linker (eg linker), E linker, X linker, 赖氨酸等溶解度促进因子。
4. PNA的N端标记时，为避免杂交时标记分子的影响在PNA和荧光标记中间添加O linker等。
5 . PNA的C端标记是，C端的末端加入赖氨酸或者L-半胱氨酸后加标记。
标记物种类
标记 | λads(nm) | λem(nm) | 标记 | λads(nm) | λem(nm) |
FAM,FITC | 492 | 518 | OregonGreen488 | 498 | 526 |
TAMRA | 553 | 576 | AlexaFluor488 | 494 | 517 |
TexasRed | 592 | 614 | AlexaFluor532 | 530 | 555 |
TO | 510 | 530 | Cy3 | 550 | 570 |
Dabcyl | 454 | – | Cy5 | 650 | 670 |
此外还有很多种类的荧光标记物，具体请咨询。